内设办公室（计划财务科）、业务科技科、人事教育科（党建办、文明办、监审科）和政策法规科4个职能科室。设泉州市气象台（泉州市海洋气象台）、泉州市气象服务中心、泉州市气象信息网络与装备保障中心、泉州市气象灾害防御技术中心、泉州市气象局会计核算中心5个直属单位。下辖晋江市气象局、石狮市气象局、南安市气象局、惠安县气象局、安溪县气象局、永春县气象局、德化县气象局7个县（市）气象局和九仙山气象站、紫帽山雷达站。（联系电话：0595-22545699）